由于产卵场的破坏，圆口铜鱼缺乏补充群体，圆口铜鱼资源越捕越少，已成为偶获种，而圆口铜鱼由于其自身生物学特性，驯养难度大，研究仍停留于驯养和人工繁殖技术方面，保护压力十分巨大。由于圆口铜鱼资源有限，许多基础研究无法开展。如圆口铜鱼的性腺发育及调控技术、圆口铜鱼主要疾病小瓜虫病的入侵机理及防治方法等有待进一步深入研究。虽然突破了圆口铜鱼的人工繁殖技术，但其苗种成活率极低。只有将人工繁殖鱼苗培育成亲鱼、实现全人工繁殖后，才能实现圆口铜鱼的物种保护。

1.

野生资源急剧下降：在金沙江部分江段渔获物组成中圆口铜鱼比例曾高达40%。然而,随着金沙江、雅砻江和长江流域梯级水电的开发，其比例不断降低。2011年向家坝截流后，其资源出现了明显的下降，2013年溪洛渡水电站和官地电站建成后，其资源量更是急剧下降，圆口铜鱼已经成为偶获性物种。

2.

产卵场基本消失：圆口铜鱼野生资源的下降与其产卵场的消失密不可分，捕获的圆口铜鱼均为库区和河道中的残留群体。四川省农业科学院水产研究所长期监测结果表明，圆口铜鱼产卵场主要分布于金沙江下游和雅砻江下游。向家坝截流后，金沙江下游圆口铜鱼产卵场完全消失，仅在金沙江攀枝花江段和雅砻江下游还残存部分产卵场。2013年溪洛渡水电站和官地电站建成后，以及随着白鹤滩和乌东德水电站的建设，这些残存的产卵场已消失殆尽。从2015年开始，已经连续3年未监测到圆口铜鱼产卵。可以基本断定，圆口铜鱼野生产卵场已经完全破坏。